Platform

Imagerie optique

Responsable technique : C. Matthews
Responsable scientifique : P.F Lenne

© Elodie Lanet – Équipe Maurange

Les personnels ingénieurs et techniciens du plateau de ressources en imagerie de l’IBDM, recensée Regroupement inter-organismes (Rio) en 2003, et IBiSA (Infrastructures Biologie Santé et Agronomie) depuis 2008 sous l’entité Picsl,  ont pour mission première de garantir la mise à disposition des techniques les plus modernes et innovantes en biophotonique, à l’ensemble des chercheurs de l’institut et de la communauté scientifique locale et nationale. Leurs activités comprennent l’acquisition et la gestion d’un parc de microscopes, la formation des utilisateurs, des doctorants (microscopes, logiciels de traitement et d’analyse d’images), l’intégration de nouveaux systèmes d’imagerie (imagerie non linéaire, et à haute résolution) par le transfert technologique émanant d’équipes de recherche (Equipe  de Pierre François Lenne) dans le cadre du Grand emprunt France BioImaging (FBI), infrastructure nationale des investissements d’avenir. Le plateau de ressource en imagerie applique une démarche qualité en suivant le référentiel de la norme Iso 9001. explant155 tshz3La performance et la stabilité des équipements sont garantis par un suivi métrologique.

Message aux utilisateurs : formule de remerciements avec N° Convention ANR à indiquer dans les publications : Nous remercions l’infrastructure France–‐BioImaging, soutenue par l’Agence Nationale de la Recherche Française (ANR–‐10–‐INBS–‐04–‐01, «Investments for the future»).

 La plateforme est membre de FBI.

PUBLICATION

MetroloJ : an ImageJ plugin to help monitor microscopes' health Cédric Matthews 1,3 and Fabrice P. Cordelières 2,3

PUBLICATION

Bull Cancer. 2007 Jan;94(1):115-25. Theory, principles and applications of fluorescent technologies in cellular biology and cancer research.

PUBLICATION

Three-dimensional imaging of small intestine morphology using non-linear optical microscopy and endogenous signals.

Ricard C, Vacca B, Weber P.
J Anat. 2012 Sep;221(3):279-83. PMID: 22697278
TEXTE

MICROSCOPIE HAUTE RÉSOLUTION

stedSTED Time-gated room
Résolution XY 50 nm
Microscope inversé avec laser blanc, 592 nm de déplétion en laser continu
2 détecteurs hybrides, 100 x et 60 x grossissement

 

 

 

TEXTE

MICROSCOPIE CHAMP PLEIN

axioimagerAxioImager M2 Apotome (salle 1023)
Microscope droit équipé en épifluorescence de filtres: Dapi, CFP, GFP, Rhod, Texas Red, Cy5
Module d’illumination structurée (Apotome) piloté par Axiovision
Imagerie: Multichannel, Zstack

 

display88AxioImager Z1 Apotome (salle 1023)
Microscope droit équipé en épifluorescence de filtres: Dapi, CFP, GFP, YFP, Rhod, Texas Red, Cy5
Module d’illumination structurée (Apotome) piloté par Axiovision
Imagerie: Multichannel, Zstack, MosaiX

 

display92AxioObserver Z1 Apotome (salle 1023)
Microscope inversé équipé en épifluorescence de filtres: Dapi, GFP, Rhod
Module d’illumination structurée (Apotome) piloté par Axiovision
Imagerie: Multichannel, Zstack, Time Laps, Mark&Find

 

display89Axioplan2Imaging Apotome (salle1023)
Microscope droit équipé en épifluorescence de filtres: Dapi, GFP, Rhod, Texas Red, Cy5
Module d’illumination structurée (Apotome) piloté par Axiovision
Imagerie: Multichannel, Zstack, Time Laps

 

display98
AxioObserver Z1 (salle 7014)
Microscope inversé équipé en épifluorescence d’un filtre: Rhod et des diodes 365nm, 470nm, 590nm
Chambre contrôlée en température et en CO2
Imagerie: Multichannel, Zstack, Time Laps, Mark&Find

 

display94DMRXA2 (salle 928)
Microscope droit équipé en épifluorescence de filtres: Dapi, GFP, Rhod
Imagerie rapide champs plein, avec caméra Cascade 128*128 pixel pilotée par Métamorph

TEXTE

 

MICROSCOPIE CONFOCALE

display99LSM 510 META (salle 928)
Microscope droit Zeiss Axioskop
Lignes d’excitation disponibles: 405, 458, 477, 488, 514, 543 et 633 nm
Piloté par le logiciel LSM

 

 

display86LSM 510 (salle 926)
Microscope inversé Zeiss Axiovert200M
Raies d’excitation disponibles : 458, 477, 488, 514, 543 et 633 nm
Piloté par le logiciel ZEN 2008

 

 

display82LSM 510 META (salle 926)
Microscope inversé Zeiss Axiovert200M
Raies d’excitation disponibles : 405, 458, 477, 488, 514, 543 et 633 nm
Piloté par le logiciel LSM

 

 

display100LSM 780 (salle 928)
Microscope droit Zeiss AxioImager Z2
Raies d’excitation disponibles : 405, 458, 488, 514, 561 et 633 nm
Equipé d’un détecteur GaAsp très sensible pour une plage de longueur d’onde spécifique
Module FCS (Fluorescence correlation spectrometry)
Piloté par le logiciel ZEN 2010

 

 

 

display96Spinning disk Perkin’s Elmer 1 caméra (salle 928)
Microscope droit Zeiss Axiovert 200M
Raies d’excitation disponibles : 488 et 561 nm
Equipé d’une caméra photometrics coolsnap HQ et piloté par Metamorph

 

 

display97Spinning disk Roper 2 caméras (salle 924)
Microscope inversé Nikon Eclilpse TI
Raies d’excitation disponibles : 405, 445, 491, 515, 561 et 633 nm
Equipé de 2 caméras Photometrics EMCCD evolve
Instrument piloté par Metamorph, dédié pour l’imagerie rapide

 

display99Biorad MRC 1024 ES (Salle 924)
Microscope Nikon Diaphot 300
Microscope confocal spécialisé dans l’UV
Equipement pédagogique

 

 

 

TEX

 

MICROSCOPIE BIPHOTONIQUE

IMG_1919Zeiss 7M, logiciel ZEN
Microscope droit avec contrôle de l’environnement
5 détecteurs non descanned
Laser Mai Tai DeepSee HP

 

 

display84Microscope inversé avec contrôle environnemental
Deux détecteurs non descanned
Laser Mai Tai DeepSee HP

 

TEXTE

 

OBJECTIFS
AxioImager Z1 Apo (salle 1023): 5x/0.5 Plan Néofluar; 10x/0.3 Plan Néofluar; 20x/0.8 Plan Apochromat; 40x/1.3 Plan Néofluar; 63x/1.4 Plan Apochromat.

AxioImager M2 Apo (salle 1023): 5x/0.5 Plan Néofluar; 10x/0.3 Plan Néofluar; 20x/0.75 Plan Apochromat; 40x/1.3 Plan Néofluar; 63x/1.4 Plan Apochromat.

Axioplan 2 (salle 1023): 5x/0.5 Plan Néofluar; 10x/0.3 Plan Néofluar Ph1; 25x/0.80 Imm Korr Néofluar; 40x/1.3 Plan Néofluar Ph2; 63x/1.4 Plan Apochromat DicIII.

AxioObserver Z1 Apo (salle 1023): 2.5x/0.075 Plan Néofluar; 5x/0.16 Plan; 10x/0.3 Plan Néofluar Ph1; 20x/0.4 LD Plan Néofluar Ph2; 40x/0.60 LD Plan Néofluar Ph2 DicII; 63x/1.4 oil Plan Apochromat.

Imager M2 (salle 730): 5x/0.15 Plan Néofluar; 10x/0.30 Plan Néofluar Ph1 DicI; 20x/0.5 Plan Néofluar DicII; 16x/0.5 Imm Plan Néofluar Ph2; 40x/1.30 oil Plan Néofluar Ph3 DicIII; 63x/1.40 oil Plan Apochromat Ph3 DicIII.

DMRB (salle 730): 5x/0.11 NPlan; 10x/0.40 Imm PL APO Dic; 20x/0.5 Fluotar DIC; 40x/0.7 Fluotar Dic.

Axioplan2 (salle 7014): 10x/0.30 W Ph1 Achroplan; 5x/0.15 Plan Néofluar; 10x/0.30 Plan Néofluar DicI; 20x/0.5 Plan Néofluar DicII; 40x/0.75 Plan Néofluar; 63x/1.25 oil Plan Néofluar DicIII.

AxioObserver Z1 (salle 7014): 2.5x/0.075 Plan; 10x/0.3 Plan Néofluar Ph1; 20x/0.40 LD Plan Néofluar Ph2 DicII; 40x/0.6 LD Plan Néofluar Ph2 DicII; 63x/1.4 oil Plan Apochromat.

LSM 510 (salle 926):10x/0.3 Plan Neofluar; 20x/0.8 Plan Apochromat; 25x/0.8 LCI Plan Neofluar; 40x/1.2 C Apochromat; 63x/1.4 Plan Apochromat; 100X/1.3 Plan Neofluar.

LSM 510 Meta (salle 926):10x/0.3 Plan Neofluar; 20x/0.75 Plan Apochromat; 40x/1.3 Plan Neofluar; 40x/1.2 C Apochromat; 63x/1.4 Plan Apochromat; 100X/1.3 Plan Neofluar.

LSM 780 (salle 928):10x/0.45 Plan Apochromat; 20x/0.8 Plan Apochromat; 25x/0.8 LD LCI Plan Apochromat; 40x/1.2 C Apochromat; 40x/1.4 Plan Apochromat; 63x/1.4 Plan Apochromat.

Spinning Roper 2 caméras (salle 924):10x/0.3 Plan Fluor; 20X/0.45 S Plan Fluor ELWD; 20x/0.75 Plan Fluor; 40x/0.6 S Plan Fluor ELWD; 100X/1.4 Plan Apo VC.

TEXTE

 

MÉTROLOGIE

Membres more

  Brice Detailleur  
Cédric Matthews
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Cédric Matthews

Ingénieur / Technicien

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Elsa Auroux-castellani

Ingénieur / Technicien

Brice Detailleur
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Brice Detailleur

Ingénieur / Technicien

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Laetitia Hudecek

Ingénieur / Technicien

Formation

Formations en interne :

  • Formations Théoriques et pratiques en Vidéomicroscopie, Microscopie confocal, Microscopie Non linéaire.
  • Formation sur les bases du traitement de l’image avec ImageJ

Formations en externe , en collaboration avec la formation permanente INSERM Marseille :

  •  De la vidéo-microscopie à la microscopie Confocale, Concepts, pratiques et contrôle qualité
  • Le traitement d’images sous ImageJ, bases conceptuelles et pratiques pour la Biologie

Formations en externe, en collaboration avec le CNRS formation entreprises :

Retrouvez ici toutes les formations, dans tous les domaines, proposées par le CNRS formation entreprises

Infos utiles

Demande d’interventions par type d’équipement

Contacts entre utilisateurs d’un même type d’équipement